Gran parte della ricerca biomedica, proteomica e genomica è essenzialmente "osservazionale"

Questo è il risultato delle tendenze tecnologiche degli ultimi 25 anni, che hanno visto progressi significativi nelle tecnologie di misurazione "high-throughput" per il sequenziamento e la trascrittomica. Parallelamente a queste tendenze, c'è sempre stato un gruppo di ricercatori che si è impegnato a sviluppare simulazioni di sistemi biochimici e biologici. Tuttavia, l'estrema complessità di questi sistemi ha limitato l'applicabilità di tali approcci. Questa presentazione illustra una storia personale di vari tipi di simulazioni che culminano nelle simulazioni di tumori solidi. Nell'era dell'intelligenza artificiale, l'obiettivo rimane quello di costruire simulatori fedeli che consentano a ricercatori e medici di perturbare, ad esempio, una cellula e osservare - potenzialmente come proprietà emergenti - alcune caratteristiche del tessuto. Naturalmente, questo si basa sulla garanzia che la causalità tra eventi sia adeguatamente preservata. In quanto tale, questo intervento è un omaggio a Sidney Brenner e alla sua comprensione dell'importanza dei linguaggi per descrivere e produrre computazioni.